1999年3月15日夜间，以卢森堡前首相桑特为主席的本届欧盟委员会20名委员，经过3个小时的讨论后，于子夜宣布集体辞职，桑特称它是个『政治行动』。这是自1958年1月《罗马条约》生效以来欧盟委员会首次集体辞职。

集体辞职的直接原因，是『独立专家委员会』15日下午提出的关于欧盟委员会舞弊、徇私和财务管理不当的报告。长达146页的报告用语苛刻，指控委员会舞弊严重、任人唯亲、管理混乱。报告称，20名委员中10人不同程度地卷入丑闻，最严重者为：负责科技事务的委员、前法国总理克勒松夫人，她在欧洲专业培训计划中徇私枉法；西班牙人马林，在实施欧盟对地中海国家援助计划中舞弊；还有负责东欧事务的荷兰人范登布鲁克、负责人道主义援助的意大利人波妮诺等，甚至连桑特也在劫难逃。1999年1月14日，欧洲议会在对欧盟委员会的不信任动议被否决后，即决定成立由5人组成的『独立专家委员会』。当时欧洲议会责成它3月15日前提交报告，23日审议。由于报告对欧盟委员会的态度严厉，欧洲议会主要党团15日晚已明确表示弹劾欧盟委员会之意，委员会只好主动退位。报告中提出的6个案例，有4例发生在1995年之前，即本届委员会成立之前。桑特1999年3月16日上午已将集体辞职的决定通报了欧盟理事会。